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Systemübersicht

Das HUMIT-System ermöglicht die Verwaltung und Integration von Forschungsdaten. Innerhalb des Projekts wurde insbesondere mit Daten aus dem Drug-Discovery-Bereich gerarbeitet, jedoch ist das System nicht auf diese Anwendungsdomäne. Die Daten können im System durch Annotationen semantisch angereichert werden. Im Anwendungsfall der Hochdurchsatzforschung wurde die im Projekt entwickelte MIABAO (Minimal Annotation Bio Assay Ontology) für die Annotationen verwendet. Damit können die Daten aus dem HUMIT-System auch mit externen Daten verknüpft werden. In der übergreifenden Betrachtung besteht gegenüber der zeitaufwändigen, vergleichenden Auswertung einzelner Screens das Potenzial weiterführender Erkenntnisse und darüber ggf. neue Wirkstoffkandidaten zu identifizieren. Die Integration von Daten aus verschiedenen Screens ist die Grundlage für die weitere Datenanalyse, z.B. mit Methoden der der Künstlichen Intelligenz oder Deep Learning. Voraussetzung hierfür ist eine qualitativ hochwertige Rohdatenbasis mit adäquaten Annotationen, so wie sie durch HUMIT-System ermöglicht wird.

Funktionen

Extraktion

Daten und Metadaten werden semi-automatisch aus den Datenquellen extrahiert.

Integration

Daten aus verschiedenen Quellen mit verschiedenen Datentypen und -formaten können zusammengeführt werden.

Sichere Datenablage

Daten und Metadaten werden in Dataspaces und Projekten abgelegt, für die ein detailliertes Benutzer- und Rollenkonzept mit spezifischen Zugriffsrechten definiert werden kann.

Semantische Annotation

Alle Daten und Metadaten können mit beliebigen Annotationen versehen werden. Für bestimmte Datensätze können Templates definiert werden, die die Metadaten-Annotationen auf bestimmte Ontologien beschränken.

Suche

Die Daten und Metadaten können über eine Freitext- facettenbasierte Suche abgefragt werden.

Demonstrationsvideo

Hier können Sie ein Demonstrationsvideo des HUMIT-Systems herunterladen.

Bericht

Im Schlussbericht sind weitere Funktionen des Systems und dessen Implementiertung dargestellt.